多组学与方法学
Multi-omics & methodology · RSS · 所有主题
10月30日 周五 5 条
Serum metabolomics analysis of individual variability in superovulation among Tan lamb Ewes and identification of lipid metabolism biomarkers
研究以18只4-8周龄滩羊母羔为对象，统一实施超数排卵后按卵泡数与卵母细胞回收量分为高、中、低产三组，采用LC-MS/MS非靶向代谢组学比较超排前后血清代谢谱，共鉴定1899种代谢物。超排前高产组与低产组代谢谱明显分离，差异代谢物富集于氨基酸生物合成及甘氨酸-丝氨酸-苏氨酸代谢；超排后富集转向苯丙氨酸与亚油酸代谢。交集分析得到8种在超排前后均呈高>中>低趋势的脂质代谢物，包括中链脂肪酸（月桂酸、辛酸、癸酸）、牛磺鹅去氧胆酸、三种溶血磷脂酰胆碱及神经节苷脂GA2，其中月桂酸、牛磺鹅去氧胆酸和LysoPC(22:1)…
推荐理由：将血清脂质代谢组与超数排卵反应个体差异关联，提出可用于供体预筛的候选标志物，思路对ART促排卵反应预测研究有借鉴意义；但为羊模型、样本量小（18只）且缺乏独立验证，结论外推需谨慎。
Mass Spectrometry-Based Proteomics Reveals Extensive Remodeling Following Autophagy-Lysosomal Flux Inhibition in Preimplantation Mouse Embryos
研究以体内受精的小鼠胚胎为对象，联合药理学抑制自噬-溶酶体流与无标记定量蛋白质组学，刻画急性自噬抑制后的胚胎应激反应。持续巴弗洛霉素A1处理导致4-至8-细胞期发育阻滞，而1-细胞期3小时短暂处理完全可逆，提示胚胎对急性自噬活性丧失的耐受窗口很窄。蛋白质组分析显示胚胎蛋白质组广泛重编程：核糖体蛋白与翻译机器协同下调，先天免疫及细胞周期检查点相关蛋白富集。作者据此提出，蛋白质稳态受损会触发伴随全局翻译关闭与发育阻滞的先天应激反应，自噬是维持胚胎蛋白质组稳态的关键因素。
推荐理由：首次以药理学+定量蛋白质组学刻画着床前胚胎对急性自噬-溶酶体流丧失的系统性应激反应，为理解胚胎发育阻滞与蛋白质稳态提供新视角；但仅限小鼠模型、缺少明确样本量与独立验证信息，临床转化有限。
Sleep deprivation compromises sperm quality and early embryo development by disrupting folate metabolism and DNA repair
研究以小鼠模型探讨睡眠剥夺（SD）损害男性生育力的分子机制。持续睡眠剥夺引起生殖细胞凋亡、精子活力下降与形态异常增多，并削弱精子受精能力、损害植入前胚胎发育。蛋白质组学显示，叶酸转运蛋白SLC46A1在睾丸组织与精子中一致性下调，叶酸代谢关键酶MTHFR及核心DNA修复蛋白RAD51、TOPBP1表达亦显著降低。在睡眠剥夺前后补充叶酸可部分恢复MTHFR、RAD51与TOPBP1表达。作者据此提出，睡眠剥夺经干扰叶酸转运与代谢、削弱精子DNA修复，进而损害精子质量与胚胎发育；靶向叶酸代谢或可缓解相关男性不育，但结…
推荐理由：将生活方式因素（睡眠剥夺）与叶酸转运/代谢及精子DNA修复联系起来，并提示叶酸补充的干预潜力，对男性生育力保护与ART前咨询有参考价值；但证据来自单一小鼠模型，样本量与统计细节在摘要中不明确，需阅读全文核实。
The hidden threat: Integrated molecular mechanisms of lead-induced reproductive toxicity from endocrine disruption to epigenetic reprogramming
该综述系统梳理铅（Pb²⁺）对男女生殖健康的毒性通路：干扰下丘脑-垂体-性腺/卵巢轴，诱发氧化应激、炎症、线粒体功能障碍、DNA损伤与凋亡，并损害精子发生、卵泡发育和卵母细胞质量；表观遗传改变可能造成持续性生殖功能障碍并影响后代。管理以减少暴露和临床螯合为主，抗氧化及微量营养素或起支持保护作用；但人类证据有限，多组学与生殖表型整合有望推动生物标志物发现和靶向干预。
推荐理由：综述较全面地整合铅暴露的男女生殖毒性与表观遗传机制，适合环境暴露和生殖毒理参考；但非原始研究，人类证据有限，对ART实验室的直接转化价值中等。
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Maternal β-catenin regulates trophectoderm development in mouse preimplantation embryos
该研究在小鼠中重新审视母源β-catenin（CTNNB1）在植入前发育中的作用：既往认为其可缺失，作者却发现母源CTNNB1在受精后激活经典Wnt信号、维持囊胚形成所必需。母源Ctnnb1缺失导致发育延迟、致密化受损、滋养外胚层（TE）细胞数减少及E18.5发育缺陷；转录组显示细胞周期、MAPK/ERK与凋亡通路广泛失调。bFGF处理或过表达Ctnnb1、Erk2、Ccnd1可部分挽救表型。机制上，母源CTNNB1促进pERK1/2核积聚与Ccnd1转录，维持TE增殖。
推荐理由：挑战“母源CTNNB1对囊胚发育可有可无”的既有认识，用遗传学、转录组与挽救实验串起Wnt–ERK–CCND1轴与TE增殖，对理解囊胚质量与培养干预（如bFGF）有直接启发。
10月29日 周四 2 条
Ablation of a maternal Cryptosporidium mRNA-binding protein results in sterile sporozoites
该研究利用隐孢子虫单细胞图谱，鉴定出一个RNA结合蛋白F-RBP，作为微小隐孢子虫雌性身份的最早标志之一。基于报告虫株，作者将转录伪时间与雌性发育真实时间对齐，发现转录命运存在模糊窗口。条件敲除显示F-RBP在体外对性别决定和早期雌性发育并非必需，但在体内至关重要，缺失后感染动物迅速痊愈；其机制与雌性晚期mRNA-蛋白复合体形成及母源RNA长期稳态维持有关，最终产生无法入侵宿主细胞的子孢子。
推荐理由：该文在寄生虫性别发育与母源RNA调控方面有新意，但研究对象为隐孢子虫感染生物学，与人类生殖医学、辅助生殖及胚胎多组学核心范畴关联很弱，生殖领域读者一般无需优先阅读。
OVOL1/2 regulate trophectoderm differentiation during the morula-to-blastocyst transition
研究对形态学优质的 8 细胞期人类胚胎进行卵裂球活检单细胞 RNA 测序，并追踪剩余胚胎至囊胚期的发育结局。结果发现，未能形成囊胚的胚胎存在合子基因组激活（ZGA）受损，OVOL1/2 作为关键 ZGA 基因在其中显著低活化。在小鼠与人类胚胎中的功能实验显示，敲低 OVOL1/2 会通过 ARPC1B 依赖机制破坏滋养外胚层分化，阻碍桑葚胚向囊胚转变。该研究为体外培养胚胎囊胚形成失败的机制提供了新线索。
推荐理由：以人类 8 细胞胚胎活检单细胞转录组结合小鼠/人胚胎功能验证，把 ZGA 缺陷与 OVOL1/2–ARPC1B–滋养外胚层分化轴联系起来，对理解囊胚形成失败的分子原因有直接价值；样本量与临床转化证据仍需后续验证。
10月28日 周三 3 条
Ginsenoside Rb1 alleviates uterine aging via AMPK-mediated mTOR inactivation
本研究探讨人参皂苷Rb1对子宫衰老的作用及机制。作者在衰老的人子宫内膜及小鼠子宫中证实，Rb1可减轻内膜基质细胞（EnSCs）的氧化应激、衰老与凋亡。蛋白组学分析显示Rb1经mTOR相关通路发挥保护作用：Rb1激活AMPK，并由AMPK介导抑制mTOR-NF-κB信号环路，从而改善衰老表型。研究表明Rb1并非选择性清除衰老细胞，而是靶向衰老相关功能障碍、恢复内膜稳态，提示其作为调控衰老的子宫衰老治疗策略的潜力。
推荐理由：首次将天然产物Rb1与子宫衰老的内膜基质细胞衰老及AMPK-mTOR-NF-κB轴联系起来，机制链条较完整，对内膜衰老与植入失败研究有参考价值；但证据以细胞与小鼠为主，距临床转化尚远。
Transcriptome and DNA methylome profiling reveal molecular responses of bovine blastocysts to trophectoderm biopsy and post-biopsy vitrification
该研究以体外生产的形态完整牛囊胚为对象，将15枚胚胎分为非活检新鲜组、活检组及活检后玻璃化组（每组5枚），对同一囊胚分别进行Smart-seq2转录组和全基因组亚硫酸氢盐测序DNA甲基化分析。结果显示，活检与玻璃化均引起差异表达基因和差异甲基化区域改变；活检相关基因富集于糖酵解、丙酮酸代谢、线粒体生物发生等通路，玻璃化还涉及内吞、细胞黏附、MAPK/TGF-β/FoxO/雌激素信号及应激相关通路。作者认为活检伴随转录与表观重塑，玻璃化带来更广泛的代谢、细胞间信号和细胞应激改变，但候选响应仍需功能验证。
推荐理由：在单胚胎水平联合转录组与DNA甲基化，系统比较活检及活检后玻璃化的分子效应，对优化胚胎活检和冷冻方案有参考价值；但每组仅5枚牛囊胚且缺乏功能验证，结论需谨慎外推。
HDAC3 deacetylase activity coordinates the reprogramming of histone acetylation and chromatin accessibility to drive zygotic genome activation during preimplantation embryonic development
该研究在植入前小鼠胚胎中探究组蛋白去乙酰化酶 HDAC3 的作用：缺失 HDAC3 去乙酰化活性的胚胎在二细胞期发生发育阻滞，发育潜能显著下降。单细胞 RNA 测序显示，晚期二细胞胚胎出现广泛转录紊乱，超过 70% 的差异基因下调，且多为主要 ZGA 基因；超低起始量 CUT&Tag 与 miniATAC-seq 进一步显示，组蛋白乙酰化重编程与染色质可及性严重受损，转录与表观遗传缺陷在主要 ZGA 基因上一致。此外，HDAC3 抑制 MERVL 表达，敲低 MERVL-int 可部分挽救胚胎发育潜能。结论：HD…
推荐理由：首次系统揭示 HDAC3 去乙酰化酶活性是 ZGA 与植入前发育的关键调控因子，并用单细胞转录组、超低起始量 CUT&Tag 与 miniATAC-seq 多组学联合验证，机制链条完整（含 MERVL 挽救实验），对理解母源-合子转换与胚胎表观重编程有较高参考价值。
10月27日 周二 4 条
Integration of ATAC- and RNA-sequencing identifies chromatin and transcriptomic signatures in classical and non-classical zebrafish osteoblasts and indicates mechanisms of entpd5a regulation
研究利用新构建的转基因斑马鱼系，从胚胎中分选出经典成骨细胞（与哺乳动物同源）与非经典成骨细胞（脊索鞘细胞），联合ATAC-seq与RNA-seq分别及整合分析，比较两类骨骼细胞的染色质开放性与转录组差异。结果显示Dlx家族因子主要参与经典成骨细胞调控，而Hox家族因子经非经典成骨细胞调控脊柱骨化。作者还对entpd5a启动子进行了数据驱动分析，实验验证了ATAC-seq结果，并提出骨化过程中entpd5a复杂表达模式的时空调控机制（启动子/增强子互作）假说，为骨发育研究提供资源性数据。
推荐理由：方法学扎实（转基因分选＋ATAC/RNA-seq整合＋启动子实验验证），但研究对象为斑马鱼骨骼发育，与生殖医学、辅助生殖及胚胎多组学（配子/植入前胚胎）关联很弱，仅对比较发育与多组学技术路线有间接参考价值，不建议作为生殖领域优先阅读。
A three-dimensional human co-culture system reveals reciprocal embryo-endometrial adaptation at implantation onset
该研究建立基于人子宫内膜类组装体（assembloid）的三维共培养体系，将人囊胚样结构（blastoid）与天然囊胚共同培养，并用时序单细胞转录组与功能扰动解析植入样进程。研究发现共培养可诱导出以SDC1+MMP7+为标志的滋养层亚群，该亚群富集细胞外基质重塑与细胞迁移相关转录特征；这一亚群在多个独立体系中可重复出现，且特异依赖蜕膜化间质共培养环境，并通过细胞间通讯分析与靶向扰动被进一步关联到间质来源的CSF3信号。与此同时，子宫内膜出现蜕膜化增强与腺体超分泌转变相关的转录变化。研究为解析植入启动阶段胚胎与子宫…
推荐理由：首次在三维人源共培养体系中系统刻画植入启动期滋养层新亚群及其与蜕膜间质的CSF3信号互作，方法可复用、结论具机制性，对植入研究与ART实验室建模均有参考价值。
Dynamic transcriptomic analysis of CCR4-NOT complex subunits identifies Cnot7 as an oogenesis-associated factor in Crassostrea gigas
该研究系统鉴定了太平洋牡蛎（Crassostrea gigas）CCR4-NOT去腺苷酸化复合体的9个亚基，系统发育与结构域分析显示各CNOT蛋白保留亚型特异性结构特征；牡蛎基因组编码CNOT7而缺失CNOT8，与已分析的无脊椎动物一致。发育表达谱显示6个Cnot基因呈母源转录本表达模式；组织特异性分析中Cnot7是唯一满足预设性腺特异表达标准的基因；单核转录组进一步显示其在卵母细胞谱系中优先表达，成熟卵母细胞中最高。结论提示Cnot7为生殖系相关候选亚基，可能参与生殖发育与早期胚胎发生。
推荐理由：首次在海洋双壳类中系统刻画CCR4-NOT复合体组成与表达动态，并借单核转录组锁定Cnot7为卵母细胞谱系候选因子，对比较生殖生物学与母源mRNA调控研究有参考价值；但对象为无脊椎动物，与人类ART临床决策距离较远，属可浏览级别。
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Low-input lipidomics reveals stage-specific lipid remodeling and differential effects of phosphatidylcholine and eicosapentaenoic acid during ovine oocyte maturation
研究采用脂质染色与UHPLC-MS/MS低起始量脂质组学，刻画绵羊卵母细胞体外成熟过程中的脂质动态。成熟MII卵母细胞的BODIPY 493/503与油红O信号高于GV期，脂滴分布更均匀；620个注释脂质中，MII期部分PC、PE、PI种类丰度较高，部分PG种类及FA 20:5较低。补充实验中，PC可提高形态学低质量C级卵母细胞的核成熟率并伴随脂质荧光升高，对A/B级无显著作用；外源EPA降低MII成熟率，300 μM EPA与异常纺锤体形态比例升高相关。结论为探索性阶段脂质图谱，PC与EPA在所用IVM条件下效…
推荐理由：首次以低起始量脂质组学系统描绘绵羊卵母细胞成熟各阶段脂质重塑，并给出PC与EPA补充对IVM成熟率的差异化效应，对卵母细胞脂质代谢与IVM培养优化有直接参考价值；但属动物模型探索性研究，样本与机制验证有限。
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10月26日 周一 4 条
A CD4-lineage erythro-myeloid progenitor within the adult bone marrow defines an alternative pathway for macrophage generation
该研究在成人骨髓中鉴定出一群此前未被认识的CD4谱系红系-髓系祖细胞（EMPROR）。这类细胞在表型和转录组上不同于造血干细胞、共同髓系祖细胞及单核前体，不表达Csf1r和Ccr2而表达Cd4与Kit。结合单细胞RNA测序、RNA速度分析和谱系实验，研究显示其具有巨噬细胞、中性粒细胞、巨核细胞和红系分化潜能，可在不依赖CCR2介导单核细胞募集的情况下生成血管周和肿瘤相关巨噬细胞，并在炎症和肿瘤状态下贡献红系与粒系。转录组比较提示EMPROR最接近胚胎红系-髓系祖细胞，表明成人骨髓保留了类胚胎造血程序。
推荐理由：发现成人骨髓中存在不依赖单核细胞的巨噬细胞生成替代途径，机制新颖且多组学验证较充分；但研究核心为造血/免疫学，与生殖医学和ART的直接关联有限，适合关注生殖免疫与胚胎来源巨噬细胞的研究者浏览。
Single-cell multi-omics reveals archetypal regulatory programs shared across T cell subsets
研究整合急性与慢性病毒感染应答中 CD4 与 CD8 T 细胞的单细胞多组学数据（scATAC+RNA-seq）与大规模 bulk ATAC-seq 数据集，系统刻画 T 细胞身份维持的模块化调控结构，发现不同亚群与谱系之间存在转录因子层面的调控程序复用。值得注意的是，在急性和慢性感染中均存在、对持久免疫至关重要的祖样 CD8 T 细胞呈现复合调控状态：兼具 CD8 耗竭程序与滤泡辅助性 CD4 T 细胞程序。作者据此提出可推广的计算框架与数据资源，用于解析适应性免疫机制及免疫治疗设计。原文未涉及生殖或胚胎相关对…
推荐理由：这是一项高质量的免疫学单细胞多组学研究，方法学（多组学整合与调控模块识别）对胚胎多组学分析有间接借鉴意义；但研究对象是病毒感染中的 T 细胞，与生殖医学、辅助生殖及胚胎生物学无直接关联，对 ART 临床和实验室决策的可迁移性有限。
The Role of NK‑Cell Dysregulation in Adverse Pregnancy Outcomes Associated with Rheumatic Immune Diseases: Mechanisms and Translational Advances
本文为综述，系统梳理蜕膜自然杀伤细胞（dNK）与外周NK细胞（pNK）在表型、细胞毒性与分泌功能上的异质性，指出NK细胞数量、亚群分布、受体信号及细胞因子释放失调可扰乱蜕膜免疫-血管微环境，参与复发性流产、子痫前期、早产与胎儿生长受限等不良结局。作者归纳六条驱动NK介导胎盘损伤的炎症轴，并指出机制证据在抗磷脂综合征中较充分，而在系统性红斑狼疮、干燥综合征、类风湿关节炎与系统性硬化中尚待阐明；同时总结NK靶向抗炎策略的转化进展，提出基于单细胞多组学与大规模队列的研究方案。原文未提供原始数据。
推荐理由：对风湿免疫病背景下NK细胞介导胎盘损伤的机制与转化策略做了较完整的归纳，并明确区分抗磷脂综合征与其他疾病的证据强度，对生殖免疫与流产机制研究方向有参考价值；但为叙述性综述、缺乏原始数据与定量整合，方法学严谨性有限，适合浏览而非必读。
Bio-dissociable platinum quantum dot cluster nanozymes for nonhormonal endometriosis therapy through microenvironment remodeling
该研究构建生物可解离铂量子点簇（PtQDC）纳米酶，用于非激素性子宫内膜异位症（EMS）治疗。PtQDC在病灶组织液中逐步解离，持续清除活性氧和活性氮，使异位内膜细胞脱离有利氧化还原窗口，导致能量代谢受损、线粒体功能障碍和凋亡。小鼠EMS模型中，PtQDC减少病灶数量和体积，重塑腹腔微环境，抑制病理性血管生成并减轻疼痛相关信号；同时降低促炎因子、升高IL-10、调节巨噬细胞表型。RNA-seq显示Ptgs2、Mmp3和Postn下调。结果表明PtQDC整合抗氧化、抗炎、抗纤维化和抗血管生成活性，是多靶点非激素治疗…
推荐理由：提出可解离铂量子点簇纳米酶这一非激素多靶点策略，并在小鼠模型中结合微环境、疼痛和转录组验证，对子宫内膜异位症相关不孕研究有参考价值；但尚缺临床与更完整方法学信息。
10月25日 周日 1 条
IL-33 modulates maternal-fetal macrophage immunometabolism and is associated with attenuation of MIA-associated behavioral abnormalities in adult offspring
研究以弓形虫可溶性速殖子抗原（STAg）在妊娠E14.5诱导小鼠母体免疫激活（MIA），并于E15.5–E17.5给予母体IL-33。蛋白组学与蛋白互作网络分析提示IL-33为候选免疫调节因子；探索性分析显示母体IL-33干预与巨噬细胞免疫表型改变、胎盘炎症减轻及成年子代MIA相关行为异常减弱相关。ST2缺陷小鼠中上述巨噬细胞复极化与炎症稳态效应消失，行为改善亦不明显。机制上IL-33与巨噬细胞糖酵解特征降低、线粒体功能改善相关，提示母胎界面免疫代谢稳态部分恢复，IL-33/ST2轴为潜在实验靶点。
推荐理由：首次从母胎界面巨噬细胞免疫代谢角度串联IL-33/ST2与MIA相关子代神经行为结局，并辅以ST2缺陷验证，机制链条较完整；但为小鼠模型、探索性设计，与ART临床决策距离较远，适合关注生殖免疫与母胎界面的读者浏览。
10月23日 周五 1 条
Loss of KAT5-dependent H2A.Z acetylation provokes chromosomal instability in recurrent pregnancy loss
研究探讨胎盘缺陷致流产的机制。小鼠滋养层细胞中特异性敲除乙酰转移酶Kat5，或引入乙酰化缺陷突变体（Kat5-Q377E G380E、Kat5-Y47A），均引起滋养层细胞分裂时严重染色体不稳定（CIN）并致胚胎致死；H2A.Z乙酰化位点突变（H2az1-K5R K8R K12R K14R）可表型模拟KAT5缺失。整合RNA-seq与CUT&Tag显示KAT5经H2A.Z乙酰化调控Aurka、Aurkb、Cenpa等有丝分裂基因转录；人滋养层干细胞中作用保守。复发性流产伴拷贝数变异患者的胎盘绒毛中KAT5及乙酰化…
推荐理由：首次将KAT5-H2A.Z乙酰化-有丝分裂基因转录轴与滋养层染色体不稳定及复发性流产联系起来，机制链条完整（小鼠遗传学、多组学、人源干细胞与临床绒毛验证），对理解流产的胎盘起源有明确推动。
10月21日 周三 2 条
Single-cell-level digital twins for preterm birth prevention strategies
该研究提出 SIMCO（Simulated Immunome Modeling of Clinical Outcomes），一个单细胞分辨率的"数字孪生"框架，用于模拟免疫调节治疗对分娩发动时间的影响，以规避早产临产（PTL）临床试验的伦理与经费障碍。作者基于新构建的孕期免疫组质谱流式图谱（涵盖九种针对早产预防预选的候选药物）训练并验证数字孪生，并在独立孕妇队列中模拟各药物对孕周长度的影响，同时给出系统层面的机制解释。结果显示四氢叶酸以及阿司匹林联合兰索拉唑为最佳候选，主要通过增强固有免疫细胞 mTOR 信号、减…
推荐理由：将单细胞免疫组学与数字孪生模拟结合用于早产药物筛选，方法学新颖且给出可验证的机制假设，对生殖免疫与计算医学研究有直接启发；但结论均为计算预测，需临床验证，且不直接涉及 ART 实验室流程。
DMRT1 is required at two steps of ovarian differentiation in rabbits
该研究利用DMRT1突变兔模型，分析DMRT1缺失对卵巢分化的影响。早期性腺转录组显示，突变性腺具有区别于对照卵巢和睾丸的特异性表达谱；突变雌兔不育，DMRT1在生殖细胞中高表达至减数分裂启动，缺失后减数分裂关键基因下调，ChIP-seq证实DMRT1可直接结合这些基因。作者提出，DMRT1除决定睾丸分化外，还参与卵巢体细胞分化启动和生殖细胞分化两个步骤，并可能作为人类女性生育力相关基因。
推荐理由：在兔模型中揭示DMRT1对卵巢分化的双重作用，补充了小鼠中缺失的表型，对性腺发育与女性生育力遗传机制有参考价值；但距ART临床直接应用尚远。
10月20日 周二 3 条
Evolution of the arbuscular mycorrhizal regulatory network through differential GRAS gene retention and protein interaction in land plants
该研究以陆生植物GRAS转录因子家族为对象，通过系统发育分析追踪丛枝菌根共生（AMS）调控网络的演化轨迹：已知共生GRAS成员分布于12个古老分化谱系，非菌根植物中多个谱系出现明显基因丢失，并据此预测3个新的候选谱系。作者在番茄中利用CRISPR-Cas9敲除、真菌定殖与丛枝形态表型分析及突变体根系转录组，证实这3个基因（SRG1–3）各自为AMS发育所必需；结合大规模系统发育基因组学与酵母双杂交、BiFC蛋白互作实验，发现共生GRAS成员组成及互作网络在不同AMS宿主间存在差异。结论认为陆生植物共生GRAS谱系…
推荐理由：这是一项扎实的植物—微生物共生演化研究（PNAS，CRISPR验证+互作实验），但主题为植物GRAS转录因子与菌根共生，与生殖医学、辅助生殖及胚胎多组学无实质关联，对ART读者价值极低，不建议作为日常推荐内容。
The Characteristics of Tumor Microenvironment by the Single Cell Profile in Endometrial Cancer of no Specific Molecular Profile (NSMP) Subtype
该研究整合单核RNA测序、空间转录组与多重免疫组化，解析无特定分子分型（NSMP）子宫内膜癌的肿瘤微环境及复发机制。发现免疫浸润减少、免疫抑制细胞（SPP1+巨噬细胞、Treg）增多；复发前原发瘤中高干性上皮细胞簇增多；tip内皮细胞及MMP11+LEF1+ CAF与血管生成和上皮-间质转化相关，CD4+ T细胞处于应激状态且功能受损。SPP1+ TAM可能经SPP1-CD44促进CD4+ T细胞应激并维持上皮干性，体外实验验证。
推荐理由：多组学整合较扎实，提出SPP1+巨噬细胞重塑NSMP子宫内膜癌免疫微环境并关联复发的新机制；但主题偏肿瘤微环境与肿瘤复发，与辅助生殖核心临床距离较远，适合关注子宫内膜病理/免疫微环境者浏览。
BCAT1 promotes acetylation of ACLY through fatty acid metabolism pathway promoting the occurrence and development of endometriosis
该研究探讨支链氨基酸转氨酶1（BCAT1）在子宫内膜异位症（EM）中的作用。作者用qRT-PCR和Western blot检测EM组织中BCAT1表达，并通过CCK-8、克隆形成、划痕和Transwell实验评估其对异位子宫内膜间质细胞（EESC）增殖、迁移和侵袭的影响；结合转录组测序、耗氧率、脂滴及胆固醇/甘油三酯检测分析脂肪酸代谢。结果显示BCAT1在EM组织中显著升高，可促进EESC恶性样行为，并正向调控脂肪酸代谢、上调ACLY表达，机制涉及组蛋白乙酰化介导的表观调控。研究提示BCAT1/ACLY轴可能是E…
推荐理由：选题切入内异症代谢重编程与表观调控，BCAT1/ACLY轴有一定新意；但证据以体外细胞实验为主，样本量与在体验证信息有限，适合作为机制线索浏览而非临床实践依据。
10月19日 周一 4 条
The gut-microbiota-endometriosis axis: a review of immune regulation, microbial dysbiosis, host transcriptomics, probiotic intervention, and dietary influences
本文为综述，系统梳理肠道菌群参与子宫内膜异位症发生与进展的证据链：菌群失调可激活免疫系统与炎症信号，加剧异位内膜病灶形成；特定菌种经雌激素代谢通路与免疫调控影响疾病微环境。文章还评述了以乳杆菌属、双歧杆菌属为代表的益生菌干预在重建菌群平衡、增强上皮屏障与减轻炎症方面的潜力，并整合宿主基因表达/转录组研究，提出微生物改变相关的分子机制、新型生物标志物与治疗靶点，主张将菌群诊断与个体化益生菌策略作为超越传统激素治疗的补充路径。原文为叙述性综述，未提供原始数据或定量合并分析。
推荐理由：选题把菌群、免疫与转录组整合到内异症这一与不孕密切相关的疾病框架内，益生菌与饮食的可干预视角对临床与后续研究有启发；但为叙述性综述、缺乏原始数据与定量证据，新颖性与严谨性有限，属于值得浏览而非必读。
Quercetin modulates key biomarkers and inhibits cell proliferation in endometriosis
该研究基于中药复方BSHQ的网络药理学分析，筛选出32个活性成分及231个靶基因，并结合GEO数据集、加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序，锁定16个与疾病相关的基因。体外实验显示，槲皮素可显著抑制子宫内膜异位症细胞系增殖，并下调SERPINE1表达；CETSA和SPR证实槲皮素与SERPINE1蛋白直接结合并增强其热稳定性。SERPINE1过表达可逆转槲皮素的抑制作用，提示SERPINE1是其关键介导靶点。研究为槲皮素治疗子宫内膜异位症提供了体外证据，但尚缺乏动物模型和临床样本验证。
推荐理由：该研究将网络药理学、单细胞转录组与多种生物物理验证结合，较完整地论证了槲皮素经SERPINE1抑制子宫内膜异位症细胞增殖的机制；但证据仅限体外细胞系，缺乏体内和临床验证，适合作为药物机制探索的参考阅读。
MZT1 as a Prognostic and Immune-related Biomarker Promoting Invasion and Metastasis in Lung Adenocarcinoma
本研究基于 TCGA、TIMER、UALCAN 数据库，并结合细胞实验，分析纺锤体组织蛋白 MZT1 在肺腺癌中的表达与功能。生物信息学结果显示，MZT1 在肺腺癌组织中高表达，且与性别、吸烟、T 分期及生存期相关，为独立预后因素（ROC AUC=0.712）；MZT1 高表达与总生存期、疾病特异性生存期更差相关，并与肿瘤突变负荷及免疫浸润减少相关。敲低 MZT1 可抑制肺腺癌细胞增殖、克隆形成、迁移、侵袭及上皮–间质转化。GSEA 提示 MZT1 富集于细胞周期与卵母细胞减数分裂通路；研究缺乏体内验证。
推荐理由：这是一项肿瘤学研究，仅以卵母细胞减数分裂通路富集与生殖生物学存在间接联系，既不涉及配子、胚胎或 ART 临床问题，也缺乏体内验证，因此对生殖医学读者的参考价值有限。
Integrative follicular fluid biomarkers for oocyte competence and IVF outcomes: from molecular networks to multianalyte panels
本文为叙述性综述，梳理卵泡液中与卵母细胞成熟、受精、胚胎发育、囊胚形成、种植及活产相关的标志物，涵盖EGF样配体、PTX3、TGF-β/BMP、细胞因子、激素、代谢物、脂质和氧化损伤标志物等。作者指出单一分析物受患者表型、促排方案、取样与检测平台影响，重复性和预测力不足，主张转向机制导向、结局特异的多分析物panel，并整合卵丘/颗粒细胞转录组、蛋白组、代谢组和脂质组；PCOS表型模型可改善解释。临床转化仍需标准化单卵泡取样、标志物与结局一一对应、靶向检测及独立前瞻验证。
推荐理由：该综述将卵泡液单标志物研究的局限与多组学、多分析物panel的转化路径系统串联，对ART实验室设计卵母细胞/胚胎结局预测研究有方法学参考价值；但属叙述性综述，证据等级和验证强度有限。
10月17日 周六 1 条
Sequential TPRX1 and HERVL activation delineates a progression toward the totipotent-like state
该研究构建TPRX1-EGFP/HERVL-tdTomato双报告人多能干细胞系，追踪8细胞样细胞（8CLC）诱导过程。单细胞转录组与时序流式显示，诱导沿“primed→TPRX1+中间态→HERVL+ 8CLC”连续轨迹推进，TPRX1激活先于HERVL，双阳性细胞转录组最接近体内8细胞胚胎。CRISPRi及RNA干预提示HERVL元件及其来源RNA参与该转变，但位点依赖机制尚未阐明。
推荐理由：以双报告系统将8CLC诱导拆解为可追踪的TPRX1→HERVL序贯步骤，并连接ZGA与全能性调控，对早期胚胎和干细胞模型研究有较高参考价值；临床转化尚早。