多组学与方法学
Multi-omics & methodology · RSS · 所有主题
11月3日 周二 2 条
LncRNA Jpx recruits EEF1A1 to enhance Cul4b mRNA stability and translation efficiency, safeguarding mitophagy and spermiogenesis in mice
研究构建 Jpx 敲除小鼠，发现该 lncRNA 缺失不影响精原细胞增殖与减数分裂，而主要损害减数分裂后的精子形成：睾丸缩小、精子数量与活力下降、畸形精子增多（残余胞质、线粒体鞘紊乱）、精子线粒体能量代谢物（G6P、异柠檬酸、ATP/GTP/NAD+）显著降低，IVF 效率与囊胚率下降。机制上，胞质富集的 Jpx 与延伸因子 EEF1A1 结合形成核糖核蛋白复合物，靶向 Cul4b mRNA 3'UTR 稳定转录并促进翻译；Jpx 缺失导致 Cul4b 减少、PINK1/LC3-II 降低与 p62 升高，即线粒…
推荐理由：机制链条完整（lncRNA–RNA 结合蛋白–靶 mRNA 稳定性/翻译–线粒体自噬），并配套精子功能、超微结构与代谢组、IVF/囊胚结局等多层表型，是男性不育与精子线粒体质量研究的扎实一手动物证据；但为小鼠模型，距 ART 实验室直接应用仍有一定距离。
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Niche Condensin Controls Stem Cell Differentiation through Genome Architecture-Regulated Neuronal Gene Networks
研究以果蝇卵巢内生殖鞘细胞（IGS）构成的干细胞生态位为对象，发现Condensin II在相对静息的IGS细胞中调控生殖干细胞后代的分步发育。生态位特异性敲低Condensin II亚基会导致生殖干细胞自我更新、囊胚细胞分化、减数分裂双链断裂形成及卵母细胞特化缺陷，并破坏生态位细胞长突起。Hi-C显示Condensin II缺失显著改变TAD组织与边界绝缘强度而非染色质区室；整合Hi-C与RNA-seq发现同一TAD内神经基因表达协同改变，敲低这些基因可共同重现表型。
推荐理由：该研究揭示了生态位细胞中Condensin II通过维持三维基因组结构和TAD边界调控干细胞谱系发育的新机制，对生殖干细胞与染色质架构研究有启发；但证据来自果蝇模型，与人类ART和临床转化的直接相关性有限，适合作为基础机制浏览。
11月2日 周一 9 条
Circadian regulation of pancreatic islet function and the transcriptome by glucocorticoid signaling
该文发表于 Nature Communications，研究糖皮质激素信号如何昼夜节律性地调控胰腺胰岛功能与转录组。条目仅提供标题与作者，未给出摘要或正文，因此无法获知研究对象（人胰岛、小鼠模型或细胞系）、具体方法（转录组测序、条件性基因敲除、节律性采样等）、样本量、统计设计与关键结论。就现有信息判断，主题为胰岛内分泌生理与节律生物学，与生殖医学、辅助生殖及胚胎多组学无直接关联。
推荐理由：主题是胰腺胰岛的昼夜节律与糖皮质激素调控，属于代谢内分泌方向，与本领域读者的核心需求（生殖内分泌、胚胎、ART 实验室）基本无关；且缺少摘要，无法评估方法与结论，不建议优先阅读。
A catalog of transcriptome genetic regulation in a consanguineous Middle Eastern biobank
研究基于卡塔尔生物银行1882名参与者，整合血液RNA测序、全基因组测序及45项临床性状，系统绘制短变异与结构变异对基因表达、异构体使用、剪接和等位基因特异性表达的调控图谱；鉴定约700万显著QTL、1379个新eGenes，精细定位29953个高置信因果位点，并揭示近亲婚配与纯合区域对调控变异负荷及隐性有害效应的影响，为中东人群基因组解读与基因组医学提供资源。
推荐理由：这是一项高质量、ancestry特异的转录组QTL资源，对人群遗传学和基因组医学有较高价值；但研究材料为血液样本与临床性状，并非生殖/ART核心场景，对胚胎与生殖临床的直接推动有限，适合作为方法学与遗传背景参考浏览。
Decoding adenomyosis: integrative insights from genetics, multiomics, and advanced computational analyses
该综述整合近期关于子宫腺肌症的遗传学、多组学与先进计算研究。子宫腺肌症是雌激素驱动、炎症性子宫疾病，导致异常出血、疼痛及不良生殖结局。研究显示特定基因与该病存在因果关联，基因组与表观遗传机制促进雌激素信号增强、孕激素信号减弱及相关炎症，并获新型3D体外细胞模型等正交验证支持。AI驱动的多组学整合平台进一步揭示有前景的治疗候选物，有望缓解疾病进展与症状并改善生育与妊娠结局。原文为叙述性综述，未提供具体样本量或效应数据。
推荐理由：以多组学与AI整合视角系统梳理子宫腺肌症的遗传与表观遗传机制，并指向3D模型与治疗候选物，对内膜相关不孕与ART临床决策有参考价值；属叙述性综述，证据强度受限。
Potential biomarker candidates for improving diagnosis and disease treatment in adenomyosis
本文为综述，系统梳理了子宫腺肌病生物标志物研究现状。腺肌病发病机制不明、与内异症及子宫肌瘤临床重叠，确诊依赖需切除子宫的组织病理学，限制了保留生育力的诊断路径。作者汇总了基于常规定量分子技术与高通量多组学（基因组、转录组、蛋白组、代谢组及微生物组）在在位内膜、血液、尿液、粪便、宫颈阴道灌洗液与阴道拭子中发现的候选标志物，如 STEAP1、TOMM20、GLT8D2、NME5、hsa_circ_008959/hsa-miR-124-3p/SLC15A4 联合VAS评分、miR-92a-3p、Weissella co…
推荐理由：系统整合了腺肌病多组学与微生物组候选标志物，并明确指出无创诊断与保留生育力诊断的未满足需求，对内膜相关疾病研究者与临床医生有较好参考价值；但为叙述性综述、缺乏定量合成与外部验证，证据层级有限。
Identification and validation of circadian rhythm-related diagnostic biomarkers for endometriosis through integrating machine learning and single-cell analysis
本研究针对子宫内膜异位症缺乏分子诊断标志物的问题，整合WGCNA、四种机器学习算法和三个独立GEO队列，筛选并验证昼夜节律相关诊断标志物。结果提示SMC2、SUV39H2和TIMELESS具有良好诊断性能；免疫浸润分析显示B细胞和CD8+ T细胞富集升高、Treg和NK细胞降低；单细胞分析发现间充质细胞比例增加，BMP、CHEMERIN和GRN等细胞通讯改变，拟时序分析提示基质细胞亚群间的转录关系。
推荐理由：该研究将昼夜节律、机器学习与单细胞分析结合，为子宫内膜异位症无创/组织诊断标志物提供了计算验证线索；但证据以公共数据再分析为主，尚缺实验验证和临床样本前瞻性验证，适合作为方法学与候选标志物参考阅读。
Amifostine improves goat sperm quality and fertility during hypothermic storage by modulating mitochondrial energy metabolism
研究在山羊精子低温稀释液中添加不同浓度阿米福汀，结合精子质量评估、非靶向蛋白质组与代谢组及人工授精，探究其保护作用与线粒体氧化磷酸化调控机制。15 μg/mL 为最佳浓度，可维持精子活力、质膜和顶体完整性，降低 ROS 与 MDA，提高抗氧化酶活性、线粒体膜电位和 ATP 含量；保存 5 天后人工授精妊娠率达 72.00%，接近鲜精的 76.20%，明显高于对照的 53.48%。多组学提示 OXPHOS、脂肪酸 β 氧化与 TCA 循环协同重编程，并涉及 AMPK/GSK3α 轴。
推荐理由：该研究将精子低温保存、线粒体代谢调控与多组学整合相结合，并在山羊人工授精中验证妊娠率，对动物精子保存液优化和能量代谢机制研究有参考价值；但物种为山羊，向人类 ART 的直接转化仍需谨慎。
CircRNA SNX11 promotes endometrial cell proliferation through GPER1 by sponging hsa-miR-1343-3p
研究针对反复种植失败（RIF）中子宫内膜细胞增殖下降、容受性不良的问题，通过对子宫内膜组织RNA测序筛选RIF相关核心基因，并在人子宫内膜基质细胞（hESCs）中用miRNA pulldown与双荧光素酶报告基因实验验证调控关系，以CCK-8检测增殖。结果显示GPER1在RIF患者内膜组织中显著下调；circRNA SNX11可海绵吸附hsa-miR-1343-3p从而上调GPER1，促进hESCs增殖、减少凋亡并调控RIF相关通路。作者据此提出circRNA SNX11–miR-1343-3p–GPER1轴可作…
推荐理由：围绕反复种植失败这一临床难点，给出circRNA–miRNA–GPER1的完整ceRNA调控轴并有多重实验验证，机制链条清晰、与内膜容受性直接相关，值得关注；但样本量与体内功能挽救实验信息有限，结论仍属体外层面。
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Extreme Protein Longevity in the Ovary: Implications for Reproductive Aging
该文为综述，围绕“长寿蛋白”（long-lived proteins）这一细胞蛋白质稳态的新兴特征展开。作者首先总结与蛋白质长寿相关的分子特征及其维持极端稳定性的机制，随后列举卵母细胞与卵巢中已知的长寿蛋白实例（如黏连蛋白 cohesin），梳理蛋白更新速率与卵母细胞老化之间的关系，并评述近期对哺乳动物卵母细胞及卵巢长寿蛋白质组的刻画研究，指出蛋白持久性在整个生殖寿命跨度上呈现的总体趋势。文末讨论蛋白质长寿对生殖衰老及衰老细胞蛋白质稳态的含义。原文为叙述性综述，未提供原始数据或系统检索方法。
推荐理由：从“蛋白寿命”这一新视角整合卵母细胞质量下降与高龄生殖衰退的机制，概念清晰，可为卵巢衰老生物标志物与 ART 实验室相关研究方向提供选题参考；但属叙述性综述，缺乏系统检索与定量证据，实用性偏概念层面。
Comprehensive proteomic profiling reveals mRNA splicing suppression during human oocyte aging
该研究对人卵母细胞衰老进行综合蛋白质组分析，比较完全生长生发泡（FGO）与MII卵母细胞，并覆盖25、30、35、40岁年龄组。结果显示FGO蛋白改变最早见于30岁，MII延迟至35或40岁，涉及mRNA剪接、翻译和染色体分离。整合转录组提示剪接机器抑制可能是卵母细胞衰老的启动因素，伴随线粒体功能与染色体分离缺陷；在小鼠和人卵母细胞中抑制剪接可验证该表型，并提名DHX15为阶段特异性衰老候选调控因子。
推荐理由：首次系统描绘多年龄组人卵母细胞蛋白质组动态，并提出剪接抑制作为衰老启动因素，结合跨物种功能验证，对生殖衰老机制与ART干预靶点有较高参考价值。
11月1日 周日 4 条
Schwann cells in the human ovary: transcriptomic and histological characterisation
该研究以人类卵巢为对象，结合转录组学与组织学方法，旨在回答人卵巢中是否存在施万细胞，并对其特征进行刻画。题目提示工作聚焦卵巢内周围神经胶质细胞的身份与分布，但所给摘要仅列出研究问题，未提供样本量、具体标志物、测序结果或结论，因此无法评估其发现强度。若结果可靠，可为卵巢神经微环境与生殖生物学提供基础资料。
推荐理由：选题涉及人卵巢施万细胞的转录组与组织学刻画，可能补充卵巢神经微环境的基础认识；但可见信息仅有研究问题，缺少结果与样本细节，适合关注卵巢生物学者浏览。
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Revealing the Action Mechanism of WISP2 in Miscarriage Based Multi-Omic Analysis and Experimental Validation
该研究对复发性流产（RM）与正常对照的绒毛组织进行单细胞RNA测序，锁定合体滋养层/绒毛外滋养层（SCT/EVT）中的WISP2，并在20例RM与20例对照的绒毛膜样本中用qRT-PCR、Western blot和免疫组化验证；同时在HTR-8细胞过表达WISP2，开展增殖、迁移与侵袭实验。结果显示RM中WISP2表达异常，体外可促进上皮样表型并伴ERK通路激活，抑制滋养层侵袭与EMT，提示其可能参与RM发病，但仍需体内验证。
推荐理由：将单细胞转录组与组织及细胞功能验证结合，聚焦RM中滋养层WISP2，主题核心且提供一定机制线索；但样本与体外证据有限，摘要中表达方向表述不够一致，适合作为RM机制研究的浏览文献。
Lactate Metabolic Restriction Is Linked to Granulosa Cell Dysfunction and Early Atresia-Like Changes via H4K12la-Mediated Epigenetic Remodeling and p53 Signaling in Goats
研究以山羊为模型，探讨卵泡闭锁早期乳酸可用性下降对颗粒细胞（GC）命运的影响。闭锁卵泡卵泡液中乳酸浓度显著低于健康卵泡；体外抑制LDH造成胞内乳酸耗竭，导致GC增殖受抑、G0/G1期阻滞而无明显凋亡增加，外源补充L-乳酸钠可部分逆转。转录组显示细胞周期与DNA复制程序广泛下调；乳酸受限伴随整体蛋白乳酸化及H4K12la降低，CUT&Tag与CUT&RUN-qPCR证实GADD45A启动子H4K12la占据减少，GADD45A敲低可部分缓解G1/S阻滞；同时p53通路激活（γH2AX、p53、p21、p38升高），…
推荐理由：首次将乳酸可用性、组蛋白H4K12乳酸化与p53/GADD45A轴串联于颗粒细胞周期阻滞与早期卵泡闭锁，机制链条完整且有多层验证（转录组、CUT&Tag、CUT&RUN-qPCR、siRNA rescue），对卵泡微环境代谢-表观遗传交叉研究有启发；但为山羊体外原代细胞实验，缺少体内验证与人类/ART样本佐证，直接转…
Pyroptotic Macrophage Extracellular Vesicles Drive miR-103a-3p Mediated Mitochondrial Dysfunction in Granulosa Cells in Diminished Ovarian Reserve
研究基于公共 GEO 单细胞转录组数据，发现衰老卵巢巨噬细胞富集焦亡特征；从焦亡巨噬细胞中分离胞外囊泡（EVs），作用于人颗粒细胞系 KGN 后，ATP 下降、ROS 升高、凋亡增加；miRNA 测序显示 EVs 富集 miR-103a-3p，抑制该 miRNA 可逆转上述损伤。机制上 miR-103a-3p 靶向 MFN2 与 BCL2L13 破坏线粒体稳态。临床样本中，卵巢储备减退（DOR）患者卵泡液 EVs 的 miR-103a-3p 升高，且与 AMH、AFC 负相关；小鼠体内 AAV 抑制 miR-10…
推荐理由：将焦亡免疫、囊泡通讯与颗粒细胞线粒体质量控制的链条打通，且有卵泡液 EVs 临床相关性与小鼠体内干预验证，对 DOR 机制理解与潜在标志物/靶点开发有参考价值；但核心实验依赖 KGN 细胞系与公共单细胞数据，人群样本量未在摘要中体现。
10月31日 周六 2 条
Correction to: Integrated Serum Pharmacochemistry, Metabolomics, and Network Pharmacology to Reveal the Material Basis and Mechanism of Juan-tong-yin in the Treatment of Endometriosis
本条为《Appl Biochem Biotechnol》刊发的更正启事（Correction），针对 Guo 等此前发表的论文——该研究以血清药物化学、代谢组学与网络药理学相结合的方式，筛选卷痛饮（Juan-tong-yin）治疗子宫内膜异位症的潜在活性成分及作用机制。更正内容本身未提供摘要，故无法获知其具体修正范围（如作者信息、图表或数据），也无法评估原始研究的样本量、实验验证与统计细节。本条仅提示原文存在需要修订之处，阅读价值主要在于提醒关注该文的研究者核对最新版本内容。
推荐理由：仅为更正启事，无摘要与实质研究内容，无法评估方法学质量，对生殖医学读者的直接价值很低；仅在需要引用该原始研究时用于核对版本。
Single-Cell Insights Into Pathogenic Profile of Orchitis and SREBP2-Associated Cholesterol Dysregulation in Spermatogenic Failure
该研究对睾丸炎患者与健康对照的睾丸组织开展单细胞转录组测序（66,147个细胞），并结合组织学验证，发现CD8+效应T细胞和炎性巨噬细胞浸润、生殖细胞丢失、未分化精原细胞周期阻滞及体细胞纤维化/凋亡；间质细胞呈SREBP2相关胆固醇合成增强。小鼠睾丸炎模型中抑制SREBP2可改善生精、减少脂质蓄积并缓解纤维化，提示免疫激活-SREBP2-胆固醇失衡轴驱动生精失败，为炎症相关男性不育提供潜在靶点。
推荐理由：该研究以人睾丸单细胞图谱揭示睾丸炎中免疫-代谢轴驱动生精失败的新机制，并在小鼠模型中验证SREBP2为可干预靶点，对男性不育机制研究和转化探索均有参考价值。
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10月30日 周五 8 条
A competitive PDLIM1-USP14 axis destabilizes ACTN4 to disturb the invasive homeostasis of trophoblast in preeclampsia
本研究针对子痫前期（PE）中绒毛外滋养细胞（EVT）侵袭不足的细胞骨架机制展开。基于 TMT 胎盘蛋白质组学，研究者发现细胞骨架衔接蛋白 PDLIM1 在 PE 胎盘中显著上调；在原代滋养细胞与细胞系中敲低 PDLIM1 可重塑肌动蛋白骨架并增强迁移侵袭，而小鼠滋养细胞特异性过表达 Pdlim1 则损害侵袭与胎盘发育。机制上，PDLIM1 结合 α-actinin-4（ACTN4）杆状结构域并竞争置换 USP14，减少 ACTN4 去泛素化，使其转向 RNF38 介导的 K48 连接泛素化与蛋白酶体降解。胎盘靶向…
推荐理由：首次提出 PDLIM1-USP14-ACTN4 蛋白稳态轴调控滋养细胞侵袭，并有胎盘靶向纳米颗粒干预的体内验证，机制链条完整；对理解子痫前期胎盘病理与早期胎盘形成有参考价值，但属产科病理而非 ART 核心环节。
Single-Cell Omics Profiling Reveals Enhanced Heterogeneity of Cord Blood Basophils at Birth
该研究纳入4对母血与脐带血配对样本（含1对单卵双胎），用流式细胞术和单细胞RNA测序比较围产期嗜碱性粒细胞的转录与功能特征。结果显示，脐带血嗜碱性粒细胞FCER1A表达较低，细胞结合及循环IgE均缺失；其转录组和功能谱与母血不同，异质性更高，双胎间个体变异小，提示差异具有生物学意义。轨迹分析显示脐带血嗜碱性粒细胞假时间更早，可能处于更幼稚状态。研究刻画了母胎界面嗜碱性粒细胞的蛋白与基因特征，但样本量小，结论需扩大验证。
推荐理由：单细胞层面刻画母胎界面嗜碱性粒细胞异质性有一定新意，双胎样本增加了内部验证；但仅4对样本、与ART胚胎/子宫内膜核心环节距离较远，适合作为生殖免疫背景浏览。
Single-Cell Immune Cis-eQTL Mendelian Randomization Prioritizes Cell-Type-Resolved Candidate Causal Genes for Endometriosis
研究利用 OneK1K 中 20 种外周血免疫细胞类型的单细胞 cis-eQTL 工具变量，对 FinnGen R12 子宫内膜异位症（20,190 例病例、130,160 例对照）开展单变异孟德尔随机化，并结合共定位与敏感性分析。在 9157 个基因-细胞类型检验中，61 个基因的 135 个关联达到 BH-FDR<0.05；默认先验下的共定位优先得到 10 个基因（6 个蛋白编码），其中 LOC102723878 与 RUVBL1 同时经 BY 校正稳健，NK 细胞 IGF1R 仅为探索性提示（PP4=0.8…
推荐理由：将单细胞 eQTL 与孟德尔随机化、共定位整合到细胞类型层面，为子宫内膜异位症的免疫遗传机制提供可检验的候选基因清单；方法框架对生殖遗传与多组学研究者有借鉴价值，但结论仍属探索性、缺乏实验验证与临床可用性。
Serum metabolomics analysis of individual variability in superovulation among Tan lamb Ewes and identification of lipid metabolism biomarkers
研究以18只4-8周龄滩羊母羔为对象，统一实施超数排卵后按卵泡数与卵母细胞回收量分为高、中、低产三组，采用LC-MS/MS非靶向代谢组学比较超排前后血清代谢谱，共鉴定1899种代谢物。超排前高产组与低产组代谢谱明显分离，差异代谢物富集于氨基酸生物合成及甘氨酸-丝氨酸-苏氨酸代谢；超排后富集转向苯丙氨酸与亚油酸代谢。交集分析得到8种在超排前后均呈高>中>低趋势的脂质代谢物，包括中链脂肪酸（月桂酸、辛酸、癸酸）、牛磺鹅去氧胆酸、三种溶血磷脂酰胆碱及神经节苷脂GA2，其中月桂酸、牛磺鹅去氧胆酸和LysoPC(22:1)…
推荐理由：将血清脂质代谢组与超数排卵反应个体差异关联，提出可用于供体预筛的候选标志物，思路对ART促排卵反应预测研究有借鉴意义；但为羊模型、样本量小（18只）且缺乏独立验证，结论外推需谨慎。
Mass Spectrometry-Based Proteomics Reveals Extensive Remodeling Following Autophagy-Lysosomal Flux Inhibition in Preimplantation Mouse Embryos
研究以体内受精的小鼠胚胎为对象，联合药理学抑制自噬-溶酶体流与无标记定量蛋白质组学，刻画急性自噬抑制后的胚胎应激反应。持续巴弗洛霉素A1处理导致4-至8-细胞期发育阻滞，而1-细胞期3小时短暂处理完全可逆，提示胚胎对急性自噬活性丧失的耐受窗口很窄。蛋白质组分析显示胚胎蛋白质组广泛重编程：核糖体蛋白与翻译机器协同下调，先天免疫及细胞周期检查点相关蛋白富集。作者据此提出，蛋白质稳态受损会触发伴随全局翻译关闭与发育阻滞的先天应激反应，自噬是维持胚胎蛋白质组稳态的关键因素。
推荐理由：首次以药理学+定量蛋白质组学刻画着床前胚胎对急性自噬-溶酶体流丧失的系统性应激反应，为理解胚胎发育阻滞与蛋白质稳态提供新视角；但仅限小鼠模型、缺少明确样本量与独立验证信息，临床转化有限。
Sleep deprivation compromises sperm quality and early embryo development by disrupting folate metabolism and DNA repair
研究以小鼠模型探讨睡眠剥夺（SD）损害男性生育力的分子机制。持续睡眠剥夺引起生殖细胞凋亡、精子活力下降与形态异常增多，并削弱精子受精能力、损害植入前胚胎发育。蛋白质组学显示，叶酸转运蛋白SLC46A1在睾丸组织与精子中一致性下调，叶酸代谢关键酶MTHFR及核心DNA修复蛋白RAD51、TOPBP1表达亦显著降低。在睡眠剥夺前后补充叶酸可部分恢复MTHFR、RAD51与TOPBP1表达。作者据此提出，睡眠剥夺经干扰叶酸转运与代谢、削弱精子DNA修复，进而损害精子质量与胚胎发育；靶向叶酸代谢或可缓解相关男性不育，但结…
推荐理由：将生活方式因素（睡眠剥夺）与叶酸转运/代谢及精子DNA修复联系起来，并提示叶酸补充的干预潜力，对男性生育力保护与ART前咨询有参考价值；但证据来自单一小鼠模型，样本量与统计细节在摘要中不明确，需阅读全文核实。
The hidden threat: Integrated molecular mechanisms of lead-induced reproductive toxicity from endocrine disruption to epigenetic reprogramming
该综述系统梳理铅（Pb²⁺）对男女生殖健康的毒性通路：干扰下丘脑-垂体-性腺/卵巢轴，诱发氧化应激、炎症、线粒体功能障碍、DNA损伤与凋亡，并损害精子发生、卵泡发育和卵母细胞质量；表观遗传改变可能造成持续性生殖功能障碍并影响后代。管理以减少暴露和临床螯合为主，抗氧化及微量营养素或起支持保护作用；但人类证据有限，多组学与生殖表型整合有望推动生物标志物发现和靶向干预。
推荐理由：综述较全面地整合铅暴露的男女生殖毒性与表观遗传机制，适合环境暴露和生殖毒理参考；但非原始研究，人类证据有限，对ART实验室的直接转化价值中等。
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Maternal β-catenin regulates trophectoderm development in mouse preimplantation embryos
该研究在小鼠中重新审视母源β-catenin（CTNNB1）在植入前发育中的作用：既往认为其可缺失，作者却发现母源CTNNB1在受精后激活经典Wnt信号、维持囊胚形成所必需。母源Ctnnb1缺失导致发育延迟、致密化受损、滋养外胚层（TE）细胞数减少及E18.5发育缺陷；转录组显示细胞周期、MAPK/ERK与凋亡通路广泛失调。bFGF处理或过表达Ctnnb1、Erk2、Ccnd1可部分挽救表型。机制上，母源CTNNB1促进pERK1/2核积聚与Ccnd1转录，维持TE增殖。
推荐理由：挑战“母源CTNNB1对囊胚发育可有可无”的既有认识，用遗传学、转录组与挽救实验串起Wnt–ERK–CCND1轴与TE增殖，对理解囊胚质量与培养干预（如bFGF）有直接启发。
10月29日 周四 2 条
Ablation of a maternal Cryptosporidium mRNA-binding protein results in sterile sporozoites
该研究利用隐孢子虫单细胞图谱，鉴定出一个RNA结合蛋白F-RBP，作为微小隐孢子虫雌性身份的最早标志之一。基于报告虫株，作者将转录伪时间与雌性发育真实时间对齐，发现转录命运存在模糊窗口。条件敲除显示F-RBP在体外对性别决定和早期雌性发育并非必需，但在体内至关重要，缺失后感染动物迅速痊愈；其机制与雌性晚期mRNA-蛋白复合体形成及母源RNA长期稳态维持有关，最终产生无法入侵宿主细胞的子孢子。
推荐理由：该文在寄生虫性别发育与母源RNA调控方面有新意，但研究对象为隐孢子虫感染生物学，与人类生殖医学、辅助生殖及胚胎多组学核心范畴关联很弱，生殖领域读者一般无需优先阅读。
OVOL1/2 regulate trophectoderm differentiation during the morula-to-blastocyst transition
研究对形态学优质的 8 细胞期人类胚胎进行卵裂球活检单细胞 RNA 测序，并追踪剩余胚胎至囊胚期的发育结局。结果发现，未能形成囊胚的胚胎存在合子基因组激活（ZGA）受损，OVOL1/2 作为关键 ZGA 基因在其中显著低活化。在小鼠与人类胚胎中的功能实验显示，敲低 OVOL1/2 会通过 ARPC1B 依赖机制破坏滋养外胚层分化，阻碍桑葚胚向囊胚转变。该研究为体外培养胚胎囊胚形成失败的机制提供了新线索。
推荐理由：以人类 8 细胞胚胎活检单细胞转录组结合小鼠/人胚胎功能验证，把 ZGA 缺陷与 OVOL1/2–ARPC1B–滋养外胚层分化轴联系起来，对理解囊胚形成失败的分子原因有直接价值；样本量与临床转化证据仍需后续验证。
10月28日 周三 3 条
Ginsenoside Rb1 alleviates uterine aging via AMPK-mediated mTOR inactivation
本研究探讨人参皂苷Rb1对子宫衰老的作用及机制。作者在衰老的人子宫内膜及小鼠子宫中证实，Rb1可减轻内膜基质细胞（EnSCs）的氧化应激、衰老与凋亡。蛋白组学分析显示Rb1经mTOR相关通路发挥保护作用：Rb1激活AMPK，并由AMPK介导抑制mTOR-NF-κB信号环路，从而改善衰老表型。研究表明Rb1并非选择性清除衰老细胞，而是靶向衰老相关功能障碍、恢复内膜稳态，提示其作为调控衰老的子宫衰老治疗策略的潜力。
推荐理由：首次将天然产物Rb1与子宫衰老的内膜基质细胞衰老及AMPK-mTOR-NF-κB轴联系起来，机制链条较完整，对内膜衰老与植入失败研究有参考价值；但证据以细胞与小鼠为主，距临床转化尚远。
Transcriptome and DNA methylome profiling reveal molecular responses of bovine blastocysts to trophectoderm biopsy and post-biopsy vitrification
该研究以体外生产的形态完整牛囊胚为对象，将15枚胚胎分为非活检新鲜组、活检组及活检后玻璃化组（每组5枚），对同一囊胚分别进行Smart-seq2转录组和全基因组亚硫酸氢盐测序DNA甲基化分析。结果显示，活检与玻璃化均引起差异表达基因和差异甲基化区域改变；活检相关基因富集于糖酵解、丙酮酸代谢、线粒体生物发生等通路，玻璃化还涉及内吞、细胞黏附、MAPK/TGF-β/FoxO/雌激素信号及应激相关通路。作者认为活检伴随转录与表观重塑，玻璃化带来更广泛的代谢、细胞间信号和细胞应激改变，但候选响应仍需功能验证。
推荐理由：在单胚胎水平联合转录组与DNA甲基化，系统比较活检及活检后玻璃化的分子效应，对优化胚胎活检和冷冻方案有参考价值；但每组仅5枚牛囊胚且缺乏功能验证，结论需谨慎外推。
HDAC3 deacetylase activity coordinates the reprogramming of histone acetylation and chromatin accessibility to drive zygotic genome activation during preimplantation embryonic development
该研究在植入前小鼠胚胎中探究组蛋白去乙酰化酶 HDAC3 的作用：缺失 HDAC3 去乙酰化活性的胚胎在二细胞期发生发育阻滞，发育潜能显著下降。单细胞 RNA 测序显示，晚期二细胞胚胎出现广泛转录紊乱，超过 70% 的差异基因下调，且多为主要 ZGA 基因；超低起始量 CUT&Tag 与 miniATAC-seq 进一步显示，组蛋白乙酰化重编程与染色质可及性严重受损，转录与表观遗传缺陷在主要 ZGA 基因上一致。此外，HDAC3 抑制 MERVL 表达，敲低 MERVL-int 可部分挽救胚胎发育潜能。结论：HD…
推荐理由：首次系统揭示 HDAC3 去乙酰化酶活性是 ZGA 与植入前发育的关键调控因子，并用单细胞转录组、超低起始量 CUT&Tag 与 miniATAC-seq 多组学联合验证，机制链条完整（含 MERVL 挽救实验），对理解母源-合子转换与胚胎表观重编程有较高参考价值。