动物模型与比较生殖
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11月3日 周二 2 条
scSTEC: Annotating Chromatin Subcompartments from Individual Single-Cell Hi-C Data via Direct Two-Dimensional Embedding and Chromosome-wise Consensus
该预印本提出scSTEC,用于直接从单个细胞的scHi-C接触矩阵注释染色质亚区室,无需数据填补、复杂上游流程或跨细胞信息共享。作者发现scGHOST构建的跨染色体矩阵本质为秩2,可利用二维基因组嵌入与染色体间共识完成注释。在bulk Hi-C、降采样模拟及人类细胞系、小鼠皮层、发育胚胎和嗅觉感觉神经元等真实scHi-C数据中,scSTEC注释效果与scGHOST相当且更易解释,并能区分细胞类型、捕捉发育动态及关联基因表达与表观遗传谱。
推荐理由:方法新颖、算法解释性较好,对胚胎与发育单细胞3D基因组研究有参考价值;但属预印本且与ART临床决策距离较远,生殖临床读者可浏览方法学部分。
Marked Mutants Allow for Rapid Non-Invasive Genotyping of Zebrafish by Visual Inspection Alone
该预印本在斑马鱼中利用CRISPR敲入策略,将包含启动子、荧光蛋白和polyA的完整次级标记盒插入目标基因编码外显子,使靶基因功能被破坏的同时永久标记突变等位基因,称为“标记突变体”。研究针对mitfa、tdp43和tdpl构建8个独立等位基因,使用孵化腺、胰腺或松果体启动子驱动GFP/RFP/BFP,发现生殖系传递效率约30%,所有等位基因均表现功能缺失;组合四个不同荧光标记可在表型出现前仅凭视觉识别tdp43/tdpl双复合杂合胚胎。该方法可减少PCR和剪鳍,简化群体管理并促进组合遗传学。
推荐理由:方法学新颖,对斑马鱼反向遗传学和动物模型管理有实用价值;但与人类生殖医学/ART核心问题距离较远,主要适合从事动物模型与发育遗传学的研究者浏览。
11月2日 周一 2 条
IGF1R trafficking is modulated by VPS25/ESCRT-II in mice and humans to control skeletal fate commitment
研究在小鼠胚胎、颅神经嵴来源细胞及患者成纤维细胞中发现,ESCRT-II 亚基 VPS25 缺失会损害成骨并促使骨软骨祖细胞向软骨命运偏移;机制上活化 IGF1R 在内体蓄积,药物抑制 IGF1R 可在体内外部分挽救谱系身份,提示 ESCRT-II–IGF 信号调控颅面骨骼命运。
推荐理由:机制新颖,揭示 VPS25/ESCRT-II 经 IGF1R 运输调控颅面骨软骨命运;但主题属骨骼发育与罕见先天综合征,与生殖医学/辅助生殖核心关联弱,且为预印本,故不作为生殖每日必读。
Bottom-heaviness stabilizes pelagic fish eggs and generates advective transport at their surface
研究以约1 mm的浮性鱼卵为对象,在模拟上层混合层与河口环境的受控剪切流中观察其动力学。鱼卵因致密胚胎与浮性油球形成重力回复力矩,表现为稳定取向或变速旋转两种可重复行为,二者均产生卵与水的相对运动。刚体旋转模型显示,状态转换取决于局部流场和发育阶段,较老卵在较低外力矩下转为旋转。结论提示仅靠扩散的模型会低估氧和废物交换速率,平流输运对预测环境因素影响胚胎存活具有重要意义。
推荐理由:该研究提出鱼卵内部密度结构可产生平流输运的新机制,对比较胚胎学和胚胎微环境有启发;但对象为海洋鱼卵,与人类辅助生殖直接相关性低,转化价值有限。
10月30日 周五 5 条
Impact of heat and sex on embryonic brain growth in dragons with temperature induced sex-reversal (Pogona vitticeps, Lacertilia: Agamidae)
研究以中心鬃狮蜥(Pogona vitticeps)为对象,该物种在孵化温度高于32 ℃时可将ZZ雄性逆转为雌性表型。作者对57枚不同发育阶段胚胎分别设置低温(28 ℃,n=26)与高温(36 ℃,n=21)孵化处理,采用缓冲卢戈氏碘对比增强显微CT与同步辐射相位衬度CT构建高分辨率神经解剖模型。结果显示:端脑区域在ZZ基因型个体(雄性及性逆转雌性)中显著大于ZW雌性;孵化温度虽影响发育速率与体型,但整体脑容量在两种温度处理间无显著差异。作者认为基因型性别对脑发育的影响强于温度作用,脑在该耐旱蜥蜴中对高温孵化具有…
推荐理由:该研究把同步辐射相位衬度CT用于胚胎神经解剖,为温度依赖性别决定与性逆转条件下的器官发育提供新影像学证据,方法学有一定借鉴价值;但物种为爬行动物,与人类辅助生殖和胚胎临床的直接关联有限,属边缘相关,适合作为比较发育生物学的浏览性阅读。
Tissue-specific transcriptomic responses to early Toxoplasma gondii infection in sheep during congenital toxoplasmosis
研究以实验感染弓形虫TgShSp1株的妊娠母羊为模型,对感染后3天与6天的小肠、肠系膜淋巴结和胎盘(placentome)进行RNA-seq。结果显示转录反应具有明显组织特异性:6天时肠系膜淋巴结干扰素与细胞因子通路显著激活,而3天时反应有限,符合虫体“静默播散”期。值得关注的是,胎盘虽未检出虫体DNA,却出现轻度干扰素相关反应及DNA修复、细胞应激通路上调,同时细胞周期、细胞外基质重塑、血管生成与缺氧通路受抑。作者据此提出,早期胎盘血管功能与组织重塑受损可能介导急性期流产,为人类先天性弓形虫病的胎盘损伤提供转化…
推荐理由:在虫体DNA未检出的胎盘即观察到血管生成与重塑通路抑制,为“宿主介导性早期流产”提供了新分子证据;但属动物模型预印本,样本量与验证细节有限,与ART临床的直接距离较远,宜作机制参考浏览。
Injectable Nanoparticles Assemble In Situ into Modular, Functionally Segmented Brain Electrodes
研究针对传统刚性生物电子器件与神经组织力学不匹配的问题,开发了一种可注射的模块化纳米颗粒配方,可在体内原位组装为力学上与组织相容、且具备功能分段的软电极。作者在鸡胚脑内验证:组装形成的水凝胶可同时支持神经元电刺激与电穿孔基因转移,并以生物惰性段在空间上限定活性区域;将两个活性段组合,可在体内对相邻细胞群体实现空间差异化的转染。研究提出一种靶向基因递送新途径,作为病毒载体与脂质纳米颗粒的替代方案,但所用为预印本,样本量与定量验证细节尚未披露。
推荐理由:该工作提出无基底、原位成型且可功能分段的软电极,并展示电穿孔空间差异化基因递送,方法学上有新意;但研究对象为脑组织电接口,与生殖医学、辅助生殖及胚胎多组学核心范畴基本无关,仅其鸡胚电穿孔递送思路对胚胎研究方法学有间接参考价值,故对本刊读者不推荐精读。
Regionalisation of muscle nucleus heterogeneity in foetal skeletal muscle
该预印本以鸡胚肢体肌肉为对象,结合单细胞与单核RNA测序及原位杂交,解析发育期骨骼肌肌核的转录异质性。研究发现肌纤维与单核成肌细胞均存在按肌腱端(tip)和中央区(central)划分的转录差异;早期胎儿阶段所有肌核呈现tip或central身份,未成熟单核成肌细胞富集于tip区。Tip肌核具显著信号转导特征,提示其与邻近肌腱成纤维细胞及未成熟成肌细胞存在分子互作,作者提出tip区是调控肌腱附着与成肌的信号中心。
推荐理由:研究在发育期骨骼肌肌核区域化与信号中心方面有新颖性,但对象为鸡胚肢体肌肉,与生殖医学/辅助生殖核心范畴距离较远,对ART实验室直接转化价值有限,故不推荐作为必读。
Epigenetic Remodeling Increases Plasticity of Bovine Fibroblasts Without Improving Embryo and Stem Cell Development
研究用多靶点小分子鸡尾酒GUSTC(抑制EZH2、G9a/GLP、HDAC和SUV39H1)处理牛成纤维细胞,以同时干预兼性与组成性异染色质。免疫荧光显示H3K9me2/3、H3K27me3和HP1α下降、H3K9乙酰化升高;无血清培养中细胞呈克隆样并上调POU5F1/NANOG。但以其为供体进行SCNT,卵裂率、囊胚率及bESC建系效率均无显著改善。结论:GUSTC可增加牛成纤维细胞可塑性,却未提升胚胎与干细胞发育能力。
推荐理由:值得浏览:多靶点表观遗传修饰鸡尾酒在牛成纤维细胞中降低抑制性组蛋白标记,但SCNT胚胎和bESC建系未获益,提供了化学重编程的阴性证据;与临床ART直接相关性有限。
10月29日 周四 2 条
Nervous system mediated cardiac arrest in mangrove killifish
研究以红树林鳉(Kryptolebias marmoratus)胚胎为对象,发现触觉或振动刺激可诱发胚胎心脏短暂完全停跳(HSPD),有时持续超过一分钟,随后自行恢复并正常搏动,且不造成损伤。该行为始于胚胎发育后期(孵化前),并在滞育期保留,受发育调控、由神经元介导,且随感觉输入表现出可塑性。作者据此提出一种此前未描述的心脏调控形式,涉及神经与心脏内在系统的相互作用,并将该鱼确立为研究保守神经心脏机制的模型。原文为预印本,样本量、统计与具体分子通路在可见摘要中未详述。
推荐理由:鱼类胚胎神经-心脏调控的发现本身较新颖,但属比较生理学/动物模型研究,与人类生殖医学、ART 实验室和胚胎多组学的直接关联很弱,仅对以鱼为模式动物做胚胎生理或环境应激研究者有参考价值。
Vaccination of pregnant mares with mRNA encoding a GPI-anchored form of the virulence-associated protein A of Rhodococcus equi induces strong IgG responses that are transferred to their foals
本研究在马红球菌(Rhodococcus equi)致幼驹肺炎的防控背景下,将10匹妊娠母马随机分为接种组与对照组,接种组于妊娠第8、10个月接受编码 GPI 锚定毒力相关蛋白 A(VapA)的 mRNA 疫苗,另一组不接种。于免疫前、产驹后约24小时及幼驹出生后1、35、63天采血。结果显示,接种组母马抗 VapA 的 IgG1、IgG4/7、IgG3/5 相对浓度显著升高,并与幼驹出生24小时血清水平高度相关;幼驹抗体水平至少维持至35天高于对照。作者认为母体 mRNA 疫苗接种可在幼驹最易感期提供体液免疫,…
推荐理由:母体 mRNA 疫苗接种经胎盘与初乳把抗体转移给幼驹,这一点对理解母胎抗体传递与新生儿免疫有参考价值;但研究对象是马属动物的细菌性肺炎,样本量小,且与人类生殖医学和 ART 临床相去甚远,因此仅适合对生殖免疫学或动物模型感兴趣的读者翻阅。