From folate to the epigenetic clock: one-carbon metabolism in oocyte quality and ovarian ageing
本文为Hum Reprod Update系统综述，检索2008年1月至2026年9月PubMed/MEDLINE文献，整合一碳代谢（OCM）的底物供给、酶调控与甲基供体代谢在卵母细胞发育、表观遗传编程及卵巢衰老中的作用，并延伸至硫代谢、谷胱甘肽与H2S信号。证据显示，小鼠卵母细胞存在左亚叶酸瞬时摄取与卵丘支持的丝氨酸转移；MTHFR磷酸化受发育调控，MAT2A抑制会降低牛囊胚发育率；牛胚胎培养液中甲硫氨酸由50降至10 µM可改变1600余个基因的甲基化。人群数据多为回顾性：MTHFR C677T TT携带者同型…
推荐理由：由Hum Reprod Update发表的系统性综述，把一碳代谢—硫代谢—表观遗传时钟整合进卵母细胞发育与卵巢衰老框架，并逐条标注证据等级与知识空白，对评估临床补充剂方案与设计后续研究有较高参考价值；但属二次文献，人群证据以回顾性为主、因果性未确立，机制结论多来自动物模型。
Independent origin of genomic imprinting in placental fish
研究以胎生鱼 Poeciliopsis prolifica 为对象，用两个近交系正反交胎盘转录组鉴定印记，发现84个蛋白编码基因具稳健印记证据，包括哺乳动物印记基因 grb10 的直系同源基因，以及作用相反、印记方向相反的相邻基因 dpp4 与 gcga（涉及糖代谢，可能缓解亲本冲突）。焦点印记基因启动子等位DNA甲基化升高，提示类似哺乳动物的表观机制；并发现营养转运基因网络趋同招募。该研究首次在非哺乳脊椎动物证实基因组印记，支持其解决亲本冲突的假说。
推荐理由：首次在非哺乳脊椎动物（胎盘鱼）展示基因组印记，并给出亲本冲突与DNA甲基化证据，概念新颖；对人类ART直接转化有限，但为印记机制与胎盘进化提供重要比较生物学参照。
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METTL3-mediated m6A modification of DNMT1 enhances ovarian cancer progression
该研究以高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）为对象，探讨RNA甲基转移酶METTL3及其m6A修饰通路的作用。遗传学或药物抑制METTL3、以及敲低其结合伙伴METTL14，均可抑制卵巢癌细胞增殖与肿瘤进展。机制上，METTL3介导的m6A沉积增强维持性DNA甲基转移酶DNMT1的翻译；抑制DNMT1引起全基因组DNA低甲基化，并上调抑癌基因TNFAIP3与FBXO32。敲低与回补实验显示，DNMT1主要介导METTL3依赖的细胞迁移调控，而抗增殖效应可能由其他下游靶点驱动。作者据此提出m6A-METTL3-DNMT…
推荐理由：机制清晰、发表于Sci Adv，对表观遗传（m6A与DNA甲基化交叉调控）读者有价值；但研究对象为卵巢上皮性癌，与卵母细胞、胚胎及辅助生殖临床基本无关，非生殖医学核心内容，仅可作表观遗传机制参考。
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Rising cell-free DNA level tracks cancer-associated methylation signal and improves multicancer detection
该研究基于43家医院1480例初治受试者（含14种癌症、良性疾病与健康对照），分析血浆游离DNA（ccfDNA）总量与癌症相关DNA甲基化信号的关系。结果显示，随ccfDNA总量升高，携带癌症相关甲基化特征的片段反而富集而非被稀释，且该现象独立于癌种、分期及人口学与临床技术协变量；ccfDNA对甲基化信号变异的解释力超过疾病分期。随ccfDNA浓度升高，各分期内检出灵敏度均提高（I期从0.55升至0.85，II期从0.59升至0.86），良性病变亦有类似趋势。作者提示ccfDNA浓度可作为独立于分期的分层变量，用…
推荐理由：PNAS大样本（1480例、43家中心）研究提出“ccfDNA升高伴随肿瘤甲基化信号富集”的反直觉结论，对液体活检的设计与分层有方法学价值；但研究对象为肿瘤患者，与生殖医学、ART及胚胎多组学无直接交集，对生殖领域读者仅为方法学借鉴。
Large-scale identification of the regulatory potential of SNPs in human neural stem cells
研究者在人神经干细胞中采用大规模并行报告基因检测（SuRE），评估了710万个SNP的转录调控潜能。在484,057个表达信号足够高的SNP中，共鉴定出7,002个具调控潜能的变异（emVars）；这些变异富集于增强子区，并常与ZBTB33、YY1、ETS等转录因子结合位点重合。将SuRE数据与eQTL及七种神经精神表型的GWAS整合后，在风险位点内（覆盖183,186个受检SNP）定位到187个emVars。该数据集为复杂表型相关遗传变异的优先级排序提供了资源。
推荐理由：方法学扎实、数据资源规模可观（710万SNP的MPRA），但对象为神经干细胞与神经精神表型，与生殖医学/胚胎研究的直接关联很弱，仅对非编码变异功能注释与GWAS后位点优先级排序的方法思路有间接借鉴价值。
A framework for genome-wide characterization of DNA methylation and variant effect prediction
该文在Nature Genetics提出一个全基因组DNA甲基化表征与遗传变异效应预测的框架，作者为Mao、Chen、Park、Theesfeld与Troyanskaya。因条目未提供摘要，无法获知具体数据、模型与验证结果；从标题看，方法旨在整合甲基化图谱与变异效应预测，提升非编码变异功能解读能力。对生殖与胚胎表观遗传研究具潜在方法学参考，但尚需原文评估其样本、统计与外部验证。
推荐理由：提出可用于非编码变异功能解读的甲基化-变异整合框架，方法学新颖且发表于Nature Genetics，对生殖/胚胎表观遗传变异研究有潜在借鉴；但无摘要、非直接生殖临床主题，需读全文确认验证强度。
Paternal Preconception Calcitriol Intervention Rescued DBDPE-Induced Transgenerational Developmental and Visual Toxicity in Zebrafish
研究将雄性斑马鱼暴露于新型阻燃剂替代物DBDPE（十溴二苯乙烷）2个月，评估其对F1、F2代的跨代影响。结果显示，父源暴露损伤F0精子质量，并导致F2仔鱼畸形率升高；即使在低剂量下，F2仍出现明显眼部畸形，并伴随行为异常、视网膜变薄和光转导基因表达失调，提示视觉系统对跨代毒性高度敏感。转录组分析发现，类固醇生物合成通路和骨化三醇合成在F1至F2代中持续受扰，且F0精巢中骨化三醇水平明显不足；在暴露期间给父本补充骨化三醇，可恢复精子质量，并减轻子代视觉与发育毒性。结论提示，父源孕前营养干预可能降低新型污染物的跨代风…
推荐理由：该研究采用多剂量、双世代设计，并结合转录组和干预验证，较完整地刻画了父源环境暴露经精巢类固醇合成通路产生跨代毒性的机制，并提出孕前营养干预思路；但证据来自斑马鱼，对人ART的转化仍需谨慎。