GAMETE：单核分辨率绘制水稻花粉染色质可及性的遗传结构图谱
GAMETE maps the genetic architecture of chromatin accessibility in rice pollen at single-nucleus resolution
研究提出GAMETE框架，将高通量单核ATAC测序（MPS-ATAC-seq）与稀疏单核数据的基因型推断和遗传作图方法整合，应用于杂交水稻花粉，同时获取4,887个单倍体细胞核的染色质可及性与基因型。结果揭示不同花粉细胞类型的染色质景观差异，发现小孢子阶段gypsy反转座子可及性异常升高、随后在精细胞中被沉默，提示监控缺口或与基因组扩张有关；并构建单细胞重组图谱、定位分离畸变位点、鉴定16,113个染色质可及性QTL（48.6%具细胞型特异性），经渐渗系验证一个细胞型特异性反式caQTL调控花粉必需基因DTM1。
推荐理由：方法学上把单核ATAC与基因型推断、caQTL作图整合，解决了单细胞数据稀疏难以遗传作图的痛点，配子发生表观遗传研究值得参考；但对象为水稻花粉，属植物生殖生物学，与人类辅助生殖临床距离较远，仅方法学可迁移。