单细胞TimeLapse-seq揭示MTA反转录转座子是小鼠合子基因组激活的必需调控因子
Single-cell TimeLapse-seq reveals MTA is an essential retrotransposon orchestrating mouse zygotic genome activation
研究开发单细胞TimeLapse-seq（scTL-seq），可在单个胚胎中实现等位基因分辨的新生RNA检测，并用于小鼠合子基因组激活（ZGA）研究。研究构建了基因与转座元件（TE）的精细转录图谱，发现原核期转录主要来自母源基因组；MTA元件在卵母细胞中转录并在原核期高度活跃，敲低MTA会破坏合子基因激活、扰动数百个TE亚家族并导致1细胞期阻滞。研究还鉴定出662条TE驱动的嵌合转录本，以及NOBOX等可能调控MTA激活的母源转录因子，提示MTA在早期胚胎发育中具有重要调控作用。
推荐理由：方法学与机制发现兼具：scTL-seq实现等位基因分辨的单胚胎新生RNA检测，并提供MTA调控小鼠ZGA的功能证据。对早期胚胎转录组、母源-合子转换及TE调控研究有直接参考价值。