整合ATAC与RNA测序鉴定经典与非经典斑马鱼成骨细胞的染色质及转录组特征并揭示entpd5a调控机制
Integration of ATAC- and RNA-sequencing identifies chromatin and transcriptomic signatures in classical and non-classical zebrafish osteoblasts and indicates mechanisms of entpd5a regulation
研究利用新构建的转基因斑马鱼系，从胚胎中分选出经典成骨细胞（与哺乳动物同源）与非经典成骨细胞（脊索鞘细胞），联合ATAC-seq与RNA-seq分别及整合分析，比较两类骨骼细胞的染色质开放性与转录组差异。结果显示Dlx家族因子主要参与经典成骨细胞调控，而Hox家族因子经非经典成骨细胞调控脊柱骨化。作者还对entpd5a启动子进行了数据驱动分析，实验验证了ATAC-seq结果，并提出骨化过程中entpd5a复杂表达模式的时空调控机制（启动子/增强子互作）假说，为骨发育研究提供资源性数据。
推荐理由：方法学扎实（转基因分选＋ATAC/RNA-seq整合＋启动子实验验证），但研究对象为斑马鱼骨骼发育，与生殖医学、辅助生殖及胚胎多组学（配子/植入前胚胎）关联很弱，仅对比较发育与多组学技术路线有间接参考价值，不建议作为生殖领域优先阅读。